Община церкви священномученика Николая, пресвитера Подольского на Подольском городском кладбище «Красная горка» была основана в 2002 году.
Начиная с апреля 2013 года, когда настоятелем был назначен священник Марк стали совершаться богослужения. Сначала под открытым небом, а затем, в приспособленном вагончике.
Затем МУП «Градостроитель» был разработан проект храма.
В течение 2003 года, усилиями прихожан и жителей города, которые могли запечатлеть свое имя на кирпиче для строящегося храма был построен фундамент.
16 апреля 2004 года архиепископ Можайский Григорий в сослужении собора духовенства заложил камень в основание стен будущего храма, а 8 сентября 2006 года освятил полностью построенный храм.
Внутри храма установлен пятиярусный иконостас с писанными на золоте иконами.
В храме регулярно совершаются богослужения и требы.
